На этой датасторе есть виртуалки или иные нужные данные? Если нет - удаляйте смело.
Сам ESXi установлен на этом же физическом диске - но на другом партишене, которого не видно. То есть таким образом убив хранилище (Datastore) вы никак не сможете навредить самому ESXi
Вот если вы начнете манипуляции на уровне RAID массива сервера, то вполне можете убить всё, включая сам ESXi Image may be NSFW.
Clik here to view.
